EMBASSYをインストールします。 EMBASSYは、EMBOSSから呼ぶバイオ系プログラムです。 1. PHYLIPのインストール ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/からソースコードをダウンロードします。私はPHYLIP-3.6b.tar.gzを落としました。 /bio/emboss/の下にフ…

T-Coffeeをインストールします。 http://www.tcoffee.org/Projects_home_page/t_coffee_home_page.htmlからソースコードをダウンロードします。私がダウンロードした時にはversion 5.05でした。 /bio/t_coffee/というディレクトリーを作って（好きなディレク…

EMBOSSをインストールします。 先にGDをインストールしておいた方がいいかも。 （私のおバカな話。X11上でコンパイルせずに、ターミナル上でコンパイルしていて、うまくいかな〜〜〜いってはまってました。X11を使いましょう。） ftp://emboss.open-bio.org/…

ClustalWをインストールします。 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/clustalw/からMacOSX用のバイナリーをダウンロードします。私は、clustalw1.82.mac-osx.tar.gzを落としました。 /bio/clustalw/というディレクトリーを作って、その中に展開したファ…

NCBI BLASTをインストールします。 1. NCBI BLAST ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/からMacOSX用のバイナリーをダウンロードします。私は、blast-2.2.16-universal-macosx.tar.gzを落としました。 /bio/blast/というディレクトリーを作って、その…

BioPerlのインストール前にいくつかのバイオインフォマティクスツールをインストールしておきます。